Родился 1 октября 1964 года в городе Москве, русский. В 1989 году окончил исторический факультет Московского государственного педагогического института им. В.И. Ленина, по специальности - история с дополнительной специальностью советское право. Кандидат политических наук, доцент.
С 1983 по 1985 гг. проходил службу в рядах Советской Армии.
В 1989 - 1991 гг. работал учителем истории и обществоведения в школе № 734.
В 1986 - 1991 гг. активно участвовал в неформальном общественно-политическом движении . Был организатором и лидером ряда неформальных политических объединений периода Перестройки ("Община", "Демократическая фракция ВЛКСМ", Конфедерация анархо-синдикалистов и др.).
С 1989 г. активно работает в рабочем и профсоюзном движении
В 1990 г. основал Информационно-исследовательский центр рабочего и профсоюзного движения "КАС-КОР".
С 1991 по 2000 гг. работал главным редактором центральной профсоюзной газеты "Солидарность" (до 1994 г. - газеты Московской федерации профсоюзов). С 1995 по 2001 гг. секретарь Федерации Независимых Профсоюзов России, курировал информационную политику и общественные связи ФНПР. В феврале 2001 г избран Заместителем Председателя ФНПР на общественных началах. Является одним из основателей и учредителей Центра социально-консервативной политики (ЦСКП), Президент межрегионального общественного фонда "Экономическая демократия".
В декабре 1999 г. был избран депутатом Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации по списку избирательного блока "Отечество - Вся Россия". В период работы Государственной Думы третьего созыва (2000 - 2003 гг.) был заместителем Председателя Комитета Государственной Думы по труду и социальной политике, заместителем руководителя фракции "Отечество - Вся Россия", Председателем Комиссии Государственной Думы по проблемам разрешения трудовых споров и конфликтов на предприятиях.
Участвовал в создании партии "Единая Россия", был членом координационного совета Союза "Единство и Отечество", делегатом учредительного съезда партии. Возглавлял консультативный совет общественных объединений при Генеральном совете партии.
В декабре 2003 г. вновь избран депутатом Государственной Думы. Является Председателем Комитета Государственной Думы по труду и социальной политике.
2 декабря 2007 г. победил на выборах в Государственную Думу от партии "Единая Россия" (возглавлял список партии по Владимирской области).
В 5 Государственной думе руководством партии назначен председатем Комитета по труду и социальной политике.
В настоящий момент - заместитель Секретаря Президиума Генерального Совета партии "Единая Россия", возглавляет Комиссию Президиума Генерального совета по агитационно-пропагандистской работе.
Андрей Исаев автор ряда статей и брошюр по истории и теории рабочего движения, вопросам развития политической системы в России,русской политической культуре, автор книг "Экономическая демократия - современная идеология традиционных профсоюзов России", "Экономическая демократия в современной России", входил в коллектив авторов книг "История профсоюзов России. Этапы, события, люди", "Профсоюзы России. Современный этап".
А.К. Исаев награжден Орденом Почета, Орденом Дружбы, медалью "В память 850-летия г. Москвы", медалью "В Память 1000-летия Казани", Благодарностью Президента Российской Федерации , Почетной грамотой Правительства РФ, Почетной грамотой Государственной Думы, Почетной грамотой Совета Федерации ФС РФ, медалью Минтруда России "За заслуги в социально-трудовой сфере", Почетными знаками ФНПР "За заслуги перед профдвижением", "За Активную работу в профсоюзах", Почетной грамотой ФНПР, орденом Российского союза ветеранов Афганистана "За заслуги", медалью "Почетный адвокат России", медалями и грамотами ряда органов государственной власти и общественных организаций.
Женат, воспитывает сына и дочь.